按规定，首套房的利率应该有折扣优惠（以前都是这样，现在折扣都已经取消），但由于国家对房价的调控政策不断出台，在金融方面，如提高银行的准备金率、调整存贷款利率等，使各大银行能用于放贷的资金日趋紧张，有些银行已到了无米下锅的地步，所以，一些银行在发放贷款时以上浮贷款利率来作补充（国家允许）。公积金与商业贷款有区别，公积金贷款的资金来源是广大职工和职工所在单位每月缴纳的住房公积金，公积金的主要用途就是为解决公积金缴纳者的购房困难（提供贷款），所以公积金贷款的利率是严格执行国家规定的，而且公积金的管理单位不是银行而是当地的公积金管理中心，银行只是个受公积金管理中心的委托来发放贷款，收取一定的手续费，公积金贷款利息的收入（收益）与银行是无关的。现在你公积金贷款已办好，11.3万元的商贷如果不办，那开发商就不会将钥匙交给你，最终还是要办的，你可以与银行这样说：据我所知，首套房的利率以前是可以折扣的，现在折扣虽然没有了，但都是执行的基准利率7.05%（5年以上期），我不是二套房，为什么利率要上浮？如果是二套房，你银行利率上浮我也没话说，问题是我不是二套房，你们是怎么认定我是二套房的？总不能随意认定吧，上浮总要上浮得有一个理由，是吧？而且我的首付是30%（首套房的标准），公积金贷款也是按首套房利率执行的，公积金管理中心的审查也是很严格的，商业贷款要算二套房，有什么证明我这是二套房？。

商业和公积金是分开计算的，现在商业贷款利率是5.1，公积金是4.0，打比方需要贷款100万，其中60万商贷，40万公积金，那么60万商业贷款时按照5.1的利率，40万的公积金是按照4.0的利率。

商业和公积金分开算的。