土地增值税的计算主要依据增值额和适用税率。增值额是转让收入减去取得土地使用权支付的金额、开发成本、费用等扣除项目后的余额。扣除项目包括取得土地时支付的价款、土地开发成本、与转让相关的税费等。税率采用四级超率累进税率，具体取决于增值额与扣除项目金额的比例。增值额未超过扣除项目金额50%的部分，税率为30%；超过50%未超过100%的部分，税率为40%；超过100%未超过200%的部分，税率为50%；超过200%的部分，税率为60%。计算时需要准确核实转让收入和各项扣除项目金额。转让收入包括货币收入、实物收入及其他经济利益。扣除项目需提供合法有效凭证，否则不得扣除。对于旧房转让，可扣除项目包括房屋评估价格、取得土地使用权支付的地价款等。实际操作中，各地税务机关对扣除项目认定可能存在差异，建议提前咨询当地税务部门。纳税人应在签订转让合同后7日内办理纳税申报，逾期可能面临滞纳金或罚款。