土地流转协议到期后的处理需结合协议条款和相关规定来判断。若协议中明确约定了到期后土地返还条款，原则上应按约定执行。对方作为土地承包权人，在流转期满后有权收回土地，但实际操作中需考虑以下因素：协议是否有续约或自动延期的特殊约定？若无明确约定，承包方收回土地需提前合理时间通知，确保耕种方有准备期。耕种方在土地上的合理投入（如改良土壤、修建水利设施等），可协商适当补偿。若耕种方继续耕种且对方未明确提出收回，可能形成事实延续关系。但长期占用可能引发纠纷，建议通过协商或调解明确权利义务。土地性质是否改变（如农用地转为建设用地）也会影响处置方式，需遵守土地用途管制要求。遇到争议时，可向农村土地承包仲裁机构申请仲裁，或通过司法途径解决。留存好流转协议、支付凭证、土地现状证明等材料是关键。不同地区对土地流转的具体实施细则可能存在差异，必要时可咨询当地农业农村部门。