土地增值税开发费用的计算主要涉及扣除项目金额的确定。在计算土地增值税时，允许扣除的开发费用分为两种情况：财务费用中的利息支出和其他房地产开发费用。对于利息支出，如果能够按转让房地产项目计算分摊并提供金融机构证明，允许据实扣除，但最高不能超过商业银行同类同期贷款利率计算的金额。这部分利息支出之外的其它房地产开发费用，按取得土地使用权所支付的金额与房地产开发成本之和的5%以内计算扣除。若利息支出不能按转让房地产项目计算分摊或无法提供金融机构证明，房地产开发费用则按取得土地使用权所支付的金额与房地产开发成本之和的10%以内计算扣除。这里需要注意，具体扣除比例由各地税务机关在规定的幅度内确定。在具体操作中，开发费用的计算要与项目开发周期、资金投入情况相匹配。建议企业在计算时保留完整的财务凭证和费用分摊依据，以便税务机关核查。不同地区的执行标准可能存在差异，需要结合当地具体规定进行核算。