在划拨土地上建造房屋时，缴纳的土地使用费和农作物赔偿费是否计入房屋原值，需要结合具体情况分析。土地使用费属于取得土地使用权过程中支付的费用，按规定应当计入房屋的计税基础或资产原值。这笔费用本质上是对土地使用的补偿，与房屋建设直接相关。农作物赔偿费是对农民青苗损失的补偿，属于征地过程中的附带支出，如果该费用发生在房屋建设之前且与取得土地直接相关，通常也可计入房屋原值。实际操作中要注意费用发生的时点和用途。若这两笔费用发生在项目建设初期，并有正规票据和审批文件支持，在办理房产登记或税务处理时，可以主张纳入房屋成本。但不同地区对这类费用的认定标准可能存在差异，建议与当地不动产登记部门或税务机关沟通确认。涉及土地房产纠纷时，关键要厘清费用性质和支付凭证。如果双方对费用归属存在争议，需要提供当时签订的补偿协议、付款凭证等原始材料作为依据。划拨土地上的权属问题较为复杂，必要时可咨询专业机构对费用性质进行认定。