根据您的描述，您父亲在办理房产证时将房产登记在您爷爷的名字下，导致目前出现了房产纠纷。针对这种情况，您可以采取以下措施进行处理。首先，您可以咨询当地的房地产管理部门，了解相关政策和法规。根据相关规定，您可以提供相关证据，如购房合同、房屋产权证明等，证明房屋实际归属于您的父亲或您自己。如果您能提供充分的证据，可能会有助于解决纠纷。其次，您可以尝试与相关当事人进行协商，寻求和解的方式。您可以与房产登记在您爷爷名下的其他相关亲属进行沟通，协商将房产登记过户到您或您父亲名下的可能性。如果双方能够达成一致意见，可以通过公证处或相关部门办理过户手续。此外，如果您无法通过协商解决纠纷，您可以考虑寻求法律援助或咨询律师的意见。律师可以根据具体情况为您提供专业的法律建议，并帮助您制定合理的解决方案。总之，针对您父亲在房产证上将房产登记在您爷爷名下导致的纠纷，您可以通过咨询房地产管理部门、与相关当事人协商以及寻求法律援助等方式来解决问题。希望您能尽快解决纠纷，维护自己的合法权益。