由于军产房是部队而不是专业开发商进行开发，在项目操作经验、规划设计、工程管理乃至物业管理等方面总会有所欠缺。这还不算是大问题，最让人担心的是：军产房售出后由其自身房产管理机构颁发其内部产权证件，转让备案也是由军队内部的产权管理部门办理。这种自己管自己的方式很难让购买者放心。 军产房买卖合同是由开发单位按照商品房买卖合同拟定的，但如合同中对不能按时入伙，开发者应负的责任并无约定。在商品房交易中，出现此种情况可以参照《商品房销售管理办法》进行处理，但此项法规并不适用于军产房，军产房不在地方部门管理范围之内。 同集资房、微利房相似，由于历史的、政策的原因，军产房也是一种产权特殊的房产。军产房毕竟是一种极其特殊的房产形式，同商品房市场每年上千万平方米的供应量，军产房供应量微乎其微，另外，此类项目大多规划为一栋住宅楼、一栋办公楼，其中办公楼部分一般为部队单位自用，部分住宅楼项目对外发售。因此军产房对商品房市场的影响力有限。