Windows Embedded不仅能够提供超过嵌入式Linux的实质性技术优势，而且也能提供商业优势。第一：Windows Embedded体现了“软件＋服务”的概念，在整个产品寿命周期中提供了完善的支持是Linux无法做到的，却是Windows Embedded的特色。第二：从事嵌入式开发的客户需要一个长期的战略，同时需要具有IP的解决方案，这些正是微软可以提供的。第三：Windows Embedded平台更为强大，能够提供更多功能与其他微软的技术无缝衔接，平台统一，而Linux需要进行资源整合，并且考虑如何带入市场。第四：对嵌入式开发商而言，整个系统设计中最大的成本损失是设计失败。对于功能复杂系统而言，使用Linux进行开发的成本很高。但是如果OEM利用Windows Embedded开发，开发风险可以降低2倍。第五：而且Windows Embedded系统的功能丰富，响应速度快，人机交互界面友好。UI、UE设计简单。Windows Embedded CE和Linux同样具有相应的源码开放、易移植、模块化、资源丰富。