商铺拆迁补偿通常包含房屋价值补偿、停产停业损失补偿和搬迁安置补偿三部分。房屋价值补偿参照周边类似商铺市场价评估确定，不能低于征收决定公告时的市场价格。停产停业损失补偿需提供完税证明，一般按前三年平均净利润或商铺租金水平计算。搬迁安置补偿则包括设备搬迁费用和临时安置费，具体标准由地方政府制定。商铺产权人要注意征收补偿方案必须公示30日以上，对评估结果有异议可申请复核。若商铺存在租赁关系，承租人有权获得装修补偿和停产停业损失补偿，这部分补偿款分配建议通过书面协议明确。实际操作中，商铺补偿往往涉及商业价值评估争议，建议保留好房产证、租赁合同、纳税记录等原始凭证。拆迁双方协商不成时，可向房屋征收部门申请协调，协调不成的有权依法申请裁决。要注意补偿协议必须明确补偿方式、金额、支付期限及违约责任等核心条款，避免口头承诺。特殊情况下，若认为补偿方案明显不合理，可通过法律途径主张权益，但需注意诉讼时效为知道具体行政行为之日起6个月内。