二手房交易征收20%个人所得税并不是新的征收办法，一直都在执行，只是执行的时候有两种方式。从原个人所得税法到2011年新修订的个人所得税法都规定财产转让所得应缴纳个人所得税，财产转让所得，以转让财产的收入额减除财产原值和合理费用后的余额，为应纳税所得额，税率为百分之二十。个人出售自有住房取得的所得（出售价与房屋原值的差额），应按“财产转让所得”项目计征个人所得税，税率为20%。但在实际操作中，由于部分房屋并不能核实房屋原值，例如此前并非购商品房买商品房所得的福利分房，无法准确计算出差额，即通过出售自有住房取得的所得，因此无法按照20%来征收。对待这类房屋，国家政策为统一按照出售总价的1%征收。也就是说，目前二手房交易个人所得税征收有两种标准，能提供房屋原值的按照出售前后差额20%征收；未能提供房源原值的，统一按照出售总价的1%征收。只有二手房交易满五年，且是唯一住房的才能免征个税。因为按照1%的总价征收的税额，往往远低于按照差额的20%征收，因此，很多能够核实原值的房屋，也被当成不能核实原值的房屋，从而按照低于真实交易价格的总价的1%征收，以此达到避税的目的。此次，国务院办公厅在通知中，要求能够核实房屋原值的，应依法严格按转让所得的20%计征。也就是说，这一通知将堵死将能够核实原值的房屋，按照不能核实原值的房屋来征个税的路子，从而增加卖房者的税负。